你问的“分开”应该是指草帽一伙在香波地群岛被大熊拍飞、伙伴们各自散开的情节。

这个情节发生在《海贼王》动画第405集大意：消失的伙伴们，草帽一伙的末日）。

• 第404集：路飞等人遭遇海军大将黄猿和战桃丸，局面危急，大熊（巴索罗米·熊）开始出现。
• 第405集：大熊依次将草帽一伙的成员拍飞到世界各地，路飞目睹伙伴一个个消失，精神崩溃，这一集是“伙伴离散”的核心集数。
• 之后第406集起进入路飞独自在亚马逊·百合的篇章。

如果问“从第几集开始分开”，第405集是最准确的答案。